调休并不能完全替代支付加班费，其适用情形有严格限制。具体分析如下：
《中华人民共和国劳动法》第四十四条【加班工资】
“有下列情形之一的，用人单位应当按照下列标准支付高于劳动者正常工作时间工资的工资报酬：（一）安排劳动者延长工作时间的，支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬；（二）休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；（三）法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。”
《中华人民共和国劳动合同法》第八十五条【加班费罚则】
“用人单位有下列情形之一的，由劳动行政部门责令限期支付劳动报酬、加班费或者经济补偿；劳动报酬低于当地最低工资标准的，应当支付其差额部分；逾期不支付的，责令用人单位按应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准向劳动者加付赔偿金：……（三）安排加班不支付加班费的；……”
结论：公司用调休来替代支付加班费的做法，仅在休息日加班且已安排调休的情况下是合法的。对于工作日延长工作时间和法定休假日的加班，直接以调休替代支付加班费不符合法律规定，属于违法行为。
建议：
固定证据：保留好加班记录（如考勤记录、加班审批单、工作沟通记录等）、工资条（显示加班费支付情况）以及公司关于调休替代加班费的相关通知或规定。 协商沟通：首先与公司人力资源部门或负责人进行沟通，明确指出相关法律规定，要求其依法支付加班费。 行政投诉：如果协商无果，可以向用人单位所在地的劳动监察部门投诉举报，由其责令公司限期支付。 申请仲裁：如投诉后公司仍不支付，可以依法向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求支付加班费及可能的赔偿金。 司法诉讼：对仲裁裁决不服的，可以在法定期限内向人民法院提起诉讼。风险提示：用人单位不依法支付加班费，不仅需要补足差额，还可能面临劳动行政部门的行政处罚（如罚款）以及向劳动者支付赔偿金的法律风险。劳动者应积极维护自身合法权益。
